導演 ：꺾고 

主演 ：張慧衝 劉美娟 柯萊兒·布翁 鄭中基 三浦貴大 

在警方介入調查奈奈美母親的墜亡事件時 ，少年偵探團的孩子們卻不見了蹤影 ，而現代當家的助手長瀨先生也不見了 。柯南等人在神秘的暗黑之塔中遇到了各式各樣的機關 ，在塔內他們還遭到了神秘人物的追趕 ，當柯南反應過來時身邊的夥伴們都消失不見，獨自尋找同伴的他想起了奈奈美的哥哥所說的話語 ，暗黑之塔寶藏的秘密即將揭曉 。